مدیرکل میراث فرهنگی فارس با اشاره به اینکه موزه پاسارگاد در دو طبقه طراحی شده که دارای یک طبقه زیرزمین و یک طبقه همکف است اظهار داشت: شکل ظاهری ساختمان با توجه به در نظر گرفتن حریم مجموعه جهانی پاسارگاد در زیر خاک مدفون است و پس از تکمیل، گردشگران این موزه را به صورت یک تپه خاکی می‌بینند که این طراحی برای حفظ حریم مجموعه جهانی پاسارگاد انجام شده است.